Phân loại proteomics

PHÂN LOẠI PROTEOMICS
Nguyễn Phương Mai, Lê Thị Liễu, Phương, Quy

PROTEOMICS BIỂU HIỆN (1)
Định nghĩa:
Nhận biết protein và phân tích định tính (chất lượng)
Tính chất:
Phân tích thành phần các protein riêng biệt có trong hỗn hợp protein phức tạp
Nhận biết các yếu tố cấu thành và phân tích số lượng tổng hợp
Phương pháp nghiên cứu:
2DGE: điện di hai chiều
HPLC: sắc ký lỏng cao áp
MS: mass spectrometry
MultiD-LC, multidimensional liquid chromatography.
PROTEOMICS BIỂU HIỆN (2)
Twyman R. M. 2004. Principles of proteomics. BIOS Scientific Publishers. p19
Hàng nghìn loại protein có thể được phân tách, định lượng và nhận biết nhanh chóng
Nhận biết các loại protein được sản xuất trong tế bào
Nhận biết các loại protein biểu hiện khác nhau giữa các mẫu khác nhau và các đặc điểm biến đổi trước quá trình dịch mã
Sử dụng protein chips trong phân tích và định lượng
PROTEOMICS BIỂU HIỆN (3)
Định nghĩa:
Các thay đổi trong biểu hiện protein trong các quá trình biệt hoá, tăng sinh và truyền tín hiệu của các tế bào cả về mặt chất lượng và định lượng
Tính chất:
Nghiên cứu về sự biểu hiện của gene
Trình tự quá trình điều khiển trong các giai đoạn mà một tế bào hoặc một tổ chức cơ thể phải trải qua trong suốt quá trình sống
PROTEOMICS CHỨC NĂNG
Định nghĩa:
Nhận biết cấu trúc phân tử của protein: Trình tự amino acid
Tính chất
Nhận biết trình tự gene tương ứng
Phương pháp sử dụng: Mass spectrometry
PROTEOMIC CẤU TRÚC (1)
Trình tự, cấu trúc và chức năng của protein có liên hệ mật thiết với nhau
Là cơ sở cho ngành Tin sinh học trong nghiên cứu lưu trữ, giới thiệu, so sánh và dự đoán các cấu trúc protein
PROTEOMIC CẤU TRÚC (2)
Định nghĩa
Nghiên cứu tính di truyền và các tương tác lý học giữa các protein cũng như các tương tác giữa các protein và nucleic acids hoặc các phân tử nhỏ
Tính chất
Phân tích các tương tác protein có thể cung cấp không chỉ chức năng của từng loại protein mà còn về chức năng của protein trong các hệ thống và các phức hợp
PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (1)
Cung cấp các thông tin có liên quan đến proteomics chức năng và phân tích vị trí protein trên phạm vi rộng
Thiết kế bản đồ liên kết proteome dựa trên các tương tác đôi giữa các protein và các tương tác cao hơn được nhận biết bởi hệ thống phân tích các phức hợp protein
Các phương pháp sử dụng:
HTI: high-throughput imaging
Y2H: yeast two hybrid system
MS, mass spectrometry, MS/MS, tandem massspectrometry.
PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (2)
PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (3)
Twyman R. M. 2004. Principles of proteomics. BIOS Scientific Publishers. p35