Gene silencing
Chia sẻ bởi Huỳnh Thị Ngọc Ánh |
Ngày 23/10/2018 |
52
Chia sẻ tài liệu: gene silencing thuộc Bài giảng khác
Nội dung tài liệu:
SiRNA - GENE SILENCING
Ứng Dụng
“Nhóm UD4”
Lớp 11sh02
“Nhóm UD4”
NỘI DUNG
“Nhóm UD4”
I. Lịch Sử
“Nhóm UD4”
Thêm một gene
Dự đoán
Kết quả
(1990)
petunia
(1998) Craig C. Mello và Andrew Fire phát biểu: nếu 2 sợi RNA kết hợp bổ sung thì làm không biểu hiện tính trạng.
I.Lịch Sử
“Nhóm UD4”
II. Nguyên Tắc
Gene silencing là thuật ngữ dùng để chỉ hiện tượng gọi là "sự câm lặng của mRNA".
Quá trình can thiệp dsRNA.
Mạch kép RNA được cắt thành những mảnh nhỏ (siRNA) bởi endonuclease Dicer.
Mạch vô nghĩa được nạp vào phức hợp RISC và liên kết phức hợp với mạch RNA bằng bắt cặp base.
Phức hợp RISC cắt mạch mRNA, và sau đó thì mRNA suy thoái.
“Nhóm UD4”
Quy trình
“Nhóm UD4”
Dicer enzyme
- Ribonuclease, họ RNA III.
21 – 25 Nu
Dicer=helicase+2RNaseIII + Protein…
Dicer dsRNA siRNA
Cắt
“Nhóm UD4”
RNA induced silencing complex
(RISC)
RISC = Protein + siRNA
“Nhóm UD4”
RISC mRNA RNA Gene Silencing
Phá vỡ
RNase
siRNA
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
1. Tạo hoa hồng xanh
“Nhóm UD4”
Yếu tố tạo ra màu xanh trên hoa hồng chính là gen delphinidin đã clone từ loài hoa păng-xê (Viola x wittrockiana).
Yếu tố vai mượn chính là gen iris nhằm tạo ra enzyme DFR (the dihydroflavonol reductase) sẽ hoàn thành chu trình phản ứng tổng hợp delphinidin trên hoa hồng.
Yếu tố mới chính là một gen nhân tạo,tạo ra bằng kỹ thuật RNA interference (RNAi).
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
2. Virus induced gene silencing (VIGS)
“Nhóm UD4”
VIGS là sự lựa chọn như một công cụ tạo ra sự im lặng nhanh chóng của gene.
VIGS đòi hỏi sự tạo thành của những con Virus tương ứng với gene tế bào vật chủ.
Sự lây nhiễm dẫn đến tổng hợp RNA mạch kép của virus, một bước để virus nhân lên.
“Nhóm UD4”
Tobacco Rattle Virus (TRV) vector gây im lặng gene phytoene desaturase trên cây Aquilegia vulgaris và cây Nicotiana benthamiana.
Vector pTRV1 (TRV RNA1) và pTRV2 (TRV RNA2).
“Nhóm UD4”
Silencing of the phytoene desaturase gene (PDS) using VIGS N. benthamiana
“Nhóm UD4”
Thực vật được nghiên cứu
Nicotiana benthamiana
Ipomoea purpurea
Narcissus pseudonarcissus
Antirrhinum majus
Salvia splendens
Papaver nudicaule
Papaver orientale
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
3. Thoái hóa điểm vàng gây mù mắt
Gene VEGF
“Nhóm UD4”
Cơ chế gây thoái hóa điểm vàng
“Nhóm UD4”
Dùng một plasmid hay một mạch vòng được thiết kế để mang một gen đến võng mạc ngăn ngừa sự biểu hiện của gen VEGF.
Phương pháp sử dụng virus lành tính để vận chuyển plasmid đến những tế bào võng mạc.
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
4. Cancer
Hepatitis B virus
Leukemia
“Nhóm UD4”
Giúp siRNA thấm qua màng tế bào
Researchers at the University of California, San Diego School of Medicine
“Nhóm UD4”
5. Ung thư não
Sử dụng những túi mỡ nhân tạo cực nhỏ có chứa plasmid được thiết kế không phải virus đi vào trong tế bào ung thư.
Plasmid này cung cấp một thiết kế kẹp tóc RNA ngắn (shRNA) để ngăn chặn sự biểu hiện của biểu bì phát triển thành nhân tố tiếp nhân receptor một sự nảy nở mạnh mẽ của tế bào khối u.
III.Ứng Dụng – gene silencing
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
6. Huntington`s disease (bệnh múa giật)
Do tiểu não bị teo
“Nhóm UD4”
Bệnh do gen Huntington sản xuất ra protein mà gây độc cho tế bào não và các thiệt hại thần kinh sau đó dẫn đến rối loạn vận động, rối loạn tâm thần và suy giảm nhận thức.
Phương pháp điều trị : Antisense Gene hoặc RNAi.
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
7. HIV
“Nhóm UD4”
Đối với HIV/AIDS, RNAi có thể nhằm vào các giai đoạn khác nhau của chu trình nhân lên của virus.
HIV tái bản bằng cách sao mã ngược để tạo thành DNA và sử dụng DNA để sản xuất các copy của nó tổng hợp protein.
Các siRNA chữa bệnh có thể được sử dụng để đánh gục mRNA của virus.
“Nhóm UD4”
A. Ngăn chặn, phá vỡ bằng cách tạo ra các điểm tiếp nhận receptor hay co-receptor.
B. Ngăn chặn sự phiên mã và dịch mã của những gen virus ngăn ngừa sự sản xuất protein và bộ gen RNA.
“Nhóm UD4”
Tài liệu tham khảo
http://cshprotocols.cshlp.org/cgi/content/full/2009/2/pdb.prot5139
http://www.bio-itworld.com/archive/121504/running.html
http://www.medscape.com/viewarticle/719383_4
http://www.ibridgenetwork.org/rfsuny/gene-therapy-for-age-related-macular-degeneration
http://www.medscape.com/viewarticle/575182_4
http://biology0170.blogspot.com/2009/11/rnai-delivery-system-crosses-blood.html
“Nhóm UD4”
http://hopes.stanford.edu/n3609/drugs-supplements-treatments/disease-mechanisms-and-drugs-target-them/protein-aggregation/anti
siRNA and miRNA Gene Silencing - From Bench to Bedside Edited by Mouldy Sioud
Plant Methods Methodology-Virus-induced gene silencing
RNA interference – Methods for Plants and Animals
RNA interference (RNAi) technology: a promising tool for medicinal plant research
Cảm ơn Thầy và các bạn đã theo dõi !!!
The End
Ứng Dụng
“Nhóm UD4”
Lớp 11sh02
“Nhóm UD4”
NỘI DUNG
“Nhóm UD4”
I. Lịch Sử
“Nhóm UD4”
Thêm một gene
Dự đoán
Kết quả
(1990)
petunia
(1998) Craig C. Mello và Andrew Fire phát biểu: nếu 2 sợi RNA kết hợp bổ sung thì làm không biểu hiện tính trạng.
I.Lịch Sử
“Nhóm UD4”
II. Nguyên Tắc
Gene silencing là thuật ngữ dùng để chỉ hiện tượng gọi là "sự câm lặng của mRNA".
Quá trình can thiệp dsRNA.
Mạch kép RNA được cắt thành những mảnh nhỏ (siRNA) bởi endonuclease Dicer.
Mạch vô nghĩa được nạp vào phức hợp RISC và liên kết phức hợp với mạch RNA bằng bắt cặp base.
Phức hợp RISC cắt mạch mRNA, và sau đó thì mRNA suy thoái.
“Nhóm UD4”
Quy trình
“Nhóm UD4”
Dicer enzyme
- Ribonuclease, họ RNA III.
21 – 25 Nu
Dicer=helicase+2RNaseIII + Protein…
Dicer dsRNA siRNA
Cắt
“Nhóm UD4”
RNA induced silencing complex
(RISC)
RISC = Protein + siRNA
“Nhóm UD4”
RISC mRNA RNA Gene Silencing
Phá vỡ
RNase
siRNA
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
1. Tạo hoa hồng xanh
“Nhóm UD4”
Yếu tố tạo ra màu xanh trên hoa hồng chính là gen delphinidin đã clone từ loài hoa păng-xê (Viola x wittrockiana).
Yếu tố vai mượn chính là gen iris nhằm tạo ra enzyme DFR (the dihydroflavonol reductase) sẽ hoàn thành chu trình phản ứng tổng hợp delphinidin trên hoa hồng.
Yếu tố mới chính là một gen nhân tạo,tạo ra bằng kỹ thuật RNA interference (RNAi).
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
2. Virus induced gene silencing (VIGS)
“Nhóm UD4”
VIGS là sự lựa chọn như một công cụ tạo ra sự im lặng nhanh chóng của gene.
VIGS đòi hỏi sự tạo thành của những con Virus tương ứng với gene tế bào vật chủ.
Sự lây nhiễm dẫn đến tổng hợp RNA mạch kép của virus, một bước để virus nhân lên.
“Nhóm UD4”
Tobacco Rattle Virus (TRV) vector gây im lặng gene phytoene desaturase trên cây Aquilegia vulgaris và cây Nicotiana benthamiana.
Vector pTRV1 (TRV RNA1) và pTRV2 (TRV RNA2).
“Nhóm UD4”
Silencing of the phytoene desaturase gene (PDS) using VIGS N. benthamiana
“Nhóm UD4”
Thực vật được nghiên cứu
Nicotiana benthamiana
Ipomoea purpurea
Narcissus pseudonarcissus
Antirrhinum majus
Salvia splendens
Papaver nudicaule
Papaver orientale
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
3. Thoái hóa điểm vàng gây mù mắt
Gene VEGF
“Nhóm UD4”
Cơ chế gây thoái hóa điểm vàng
“Nhóm UD4”
Dùng một plasmid hay một mạch vòng được thiết kế để mang một gen đến võng mạc ngăn ngừa sự biểu hiện của gen VEGF.
Phương pháp sử dụng virus lành tính để vận chuyển plasmid đến những tế bào võng mạc.
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
4. Cancer
Hepatitis B virus
Leukemia
“Nhóm UD4”
Giúp siRNA thấm qua màng tế bào
Researchers at the University of California, San Diego School of Medicine
“Nhóm UD4”
5. Ung thư não
Sử dụng những túi mỡ nhân tạo cực nhỏ có chứa plasmid được thiết kế không phải virus đi vào trong tế bào ung thư.
Plasmid này cung cấp một thiết kế kẹp tóc RNA ngắn (shRNA) để ngăn chặn sự biểu hiện của biểu bì phát triển thành nhân tố tiếp nhân receptor một sự nảy nở mạnh mẽ của tế bào khối u.
III.Ứng Dụng – gene silencing
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
6. Huntington`s disease (bệnh múa giật)
Do tiểu não bị teo
“Nhóm UD4”
Bệnh do gen Huntington sản xuất ra protein mà gây độc cho tế bào não và các thiệt hại thần kinh sau đó dẫn đến rối loạn vận động, rối loạn tâm thần và suy giảm nhận thức.
Phương pháp điều trị : Antisense Gene hoặc RNAi.
“Nhóm UD4”
III.Ứng Dụng – gene silencing
7. HIV
“Nhóm UD4”
Đối với HIV/AIDS, RNAi có thể nhằm vào các giai đoạn khác nhau của chu trình nhân lên của virus.
HIV tái bản bằng cách sao mã ngược để tạo thành DNA và sử dụng DNA để sản xuất các copy của nó tổng hợp protein.
Các siRNA chữa bệnh có thể được sử dụng để đánh gục mRNA của virus.
“Nhóm UD4”
A. Ngăn chặn, phá vỡ bằng cách tạo ra các điểm tiếp nhận receptor hay co-receptor.
B. Ngăn chặn sự phiên mã và dịch mã của những gen virus ngăn ngừa sự sản xuất protein và bộ gen RNA.
“Nhóm UD4”
Tài liệu tham khảo
http://cshprotocols.cshlp.org/cgi/content/full/2009/2/pdb.prot5139
http://www.bio-itworld.com/archive/121504/running.html
http://www.medscape.com/viewarticle/719383_4
http://www.ibridgenetwork.org/rfsuny/gene-therapy-for-age-related-macular-degeneration
http://www.medscape.com/viewarticle/575182_4
http://biology0170.blogspot.com/2009/11/rnai-delivery-system-crosses-blood.html
“Nhóm UD4”
http://hopes.stanford.edu/n3609/drugs-supplements-treatments/disease-mechanisms-and-drugs-target-them/protein-aggregation/anti
siRNA and miRNA Gene Silencing - From Bench to Bedside Edited by Mouldy Sioud
Plant Methods Methodology-Virus-induced gene silencing
RNA interference – Methods for Plants and Animals
RNA interference (RNAi) technology: a promising tool for medicinal plant research
Cảm ơn Thầy và các bạn đã theo dõi !!!
The End
* Một số tài liệu cũ có thể bị lỗi font khi hiển thị do dùng bộ mã không phải Unikey ...
Người chia sẻ: Huỳnh Thị Ngọc Ánh
Dung lượng: |
Lượt tài: 1
Loại file:
Nguồn : Chưa rõ
(Tài liệu chưa được thẩm định)